Lambang Kabupaten Manokwari Selatan mencerminkan potensi alam (laut, hutan, gunung), kekayaan sumber daya energi, serta nilai-nilai perjuangan, persatuan, dan keberaninan masyarakat Papua, dengan elemen seperti perahu layar, gelombang biru melambangkan laut, perisai, burung Kasuari sebagai simbol kekuatan, serta kombinasi warna emas (sumber daya) dan biru (ketenangan) yang merepresentasikan filosofi pembangunan daerah dan identitas Papua Barat, seperti terlihat pada lambang Papua Barat yang memiliki kesamaan filosofi.
Elemen Utama dan Maknanya (Berdasarkan Filosofi Lambang Daerah Papua/Papua Barat):
Perahu Layar Kuning Emas: Melambangkan kekayaan sumber daya alam (pertambangan, hasil laut) serta semangat perjuangan dan kemajuan.
Tiga Baris Gelombang Biru: Melambangkan potensi kelautan yang melimpah dan perjalanan masa depan daerah.
Perisai Putih: Melambangkan perlindungan, persatuan, dan landasan Pancasila sebagai kekuatan untuk melindungi rakyat.
Burung Kasuari (Leher dan Kepala): Simbol ketangguhan, keberanian, kekuatan, dan ketahanan masyarakat Papua dalam menghadapi tantangan, serta menunjukkan posisi geografis di wilayah "Kepala Burung" Papua.
Warna Biru: Melambangkan ketenangan, kerjasama, dan kesatuan.
Warna Emas (Kuning): Melambangkan kekayaan sumber daya alam Papua, khususnya hasil bumi.
Bidang Hijau diapit Tiga Bidang Biru: Mencerminkan kesatuan tekad antara Pemerintah, Rakyat/Adat, dan Agama untuk mewujudkan pembangunan.
Secara keseluruhan, lambang ini menggambarkan identitas geografis, kekayaan alam, serta semangat juang dan persatuan masyarakat Manokwari Selatan dan Papua Barat untuk membangun masa depan yang cerah.
